กองเรืออูที่ 9 (เยอรมัน: 9. Unterseebootsflottille; อังกฤษ: 9th U-boat Flotilla) ได้รับการก่อตั้งขึ้นในเดือนตุลาคม ค.ศ. 1941 ในแบร็สต์ ซึ่งเริ่มปฏิบัติการในเดือนเมษายน ค.ศ. 1942 หลังจากการรบครั้งแรกพร้อมเรือดำน้ำ อู-213 ได้ถึงฐานแบร็สต์เมื่อวันที่ 20 มีนาคม ค.ศ. 1942 กองเรือที่ปฏิบัติการส่วนใหญ่อยู่ในเรืออูแบบ VII และมุ่งเน้นความพยายามเป็นหลักในแอตแลนติกเหนือ โดยต่อต้านกลุ่มเรือที่เดินทางไปและกลับจากบริเตนใหญ่ กองเรือนี้ได้ทำหน้าที่จากแบร็สต์จนกระทั่งฐานถูกคุกคามโดยกองกำลังอเมริกัน อู-256 ซึ่งเป็นลำสุดท้ายของกองเรืออู ได้ออกจากแบร็สต์เมื่อวันที่ 4 กันยายน ค.ศ. 1944 ไปยังแบร์เกน ประเทศนอร์เวย์ และนั่นเป็นจุดสิ้นสุดของกองเรือที่ 9 เรือที่รอดทุกลำได้รับการกำหนดใหม่ให้แก่กองเรืออูที่ 11 ในแบร์เกนสัญลักษณ์ของกองเรือที่ 9 คือ "ปลากระโทงดาบหัวร่อ" (Der lachende Schwertfisch) ได้กลายเป็นสัญลักษณ์ของหน่วยหลังจากเลมัน-วิลเลนโบค ได้รับคำสั่ง ซึ่งก่อนหน้านี้เคยเป็นสัญลักษณ์ของหอบังคับการเรือใต้น้ำตามคำสั่งก่อนหน้า โดยอู-96 ที่มีชื่อเสียงในภาพยนตร์ "ดาส โบท"